W przeciwieństwie do swoich rodziców, Boruto został uznany jako geniusz jeszcze przed tym kiedy został shinobi. Zanim zdał egzaminy w Akademii, mógł wykonać zaawansowaną technikę podziału klonów i miał wysoki stopień w umiejętności taijutsu. Pokazał także zauważalne, gwałtowne ruchy podczas zabawy z jego ojcem. Jako potomek klanu Uzumaki, Boruto został obdarzony niezwykłą siłą życiową i wytrzymałością.
Czakra i Sprawność Fizyczna
Boruto wykazał pewien stopień biegłości w Taijutsu, ponieważ będąc studentem akademii, był już w stanie sparować się ze swoim ojcem używając Cienistych Klonów. Jest też w stanie walczyć za pomocą stylu Delikatnej Pięści w ograniczonym zakresie, gdyż nie posiada Byakugana, więc nie może wycelować w tanketsu przeciwnika.
Ninjutsu
Transformacja Natury
W przeciwieństwie do swoich poprzedników, Boruto jest w stanie używać Rasengana stosując transformację natury wiatru, co pozwala mu zniknąć w połowie lotu. Będąc Geninem Boruto nauczył się używać Uwolnienia Wiatru i Błyskawicy, a do czasu Egzaminu na Chūnina nauczył się Uwolnienia Wody.
Kāma
Dōjutsu
Jōgan
Jōgan Boruto.
Boruto wykazywał zdolność do podświadomego aktywowania dōjutsu w jego prawym oku, które jest pozbawione źrenicy i ma zaciemnioną twardówkę. Daje mu zdolność do wykrywania rzeczy, które zwykle są niewidoczne dla normalnego oka. Kilka lat później pokazano, że może go aktywować według woli, wraz z czarnymi oznaczeniami na prawym ramieniu i twarzy.
Boruto potrafił porozumieć się z duchem umierającego Momoshikiego. Jak wyjaśnił Momoshiki, to dlatego, że posiada krew osoby posiadającej Byakugan.